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青科沙龙:华安生物邀请青年学者分享科学发现

青科沙龙第51期丨可解释的人工智能应用于系统生物学和医学信息学
2023-09-18
2023年5月9日,哥本哈根大学、哈佛大学医学院的科学家在 Nature Medicine 期刊发表了题为:A deep learning algorithm to predict risk of pancreatic cancer from disease trajectories 的研究论文。研究团队训练出了一种名为CancerRiskNet的深度学习算法,只需要向AI提供患者电子病历数据,就能推算出患者患上胰腺癌的风险。这一算法能在胰腺癌发生前3年推测出患病风险,可谓是AI的“精准算命”。
青科沙龙第50期丨人体肌肉骨骼系统基因表达数据库的构建和应用
2023-09-18
该研究利用生物信息学计算工具和云数据库平台,构建了首个大规模、标准化、可交互的人体肌肉骨骼系统基因表达数据库MSdb,并利用数据库收集的单细胞数据,开发了基于变分自编码器(Variational autoencoder,VAE)深度学习架构的单细胞数据整合分析算法scVAE,为肌肉骨骼系统高通量测序数据的深入挖掘和高效利用提供了有力的工具。
青科沙龙第49期丨抗体基因超突变的DNA柔性基础
2023-09-18
2023年4月24日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心孟飞龙团队和上海交大医学院上海市免疫学研究所叶菱秀团队(博士生王燕燕为论文第一作者)在国际顶尖学术期刊 Cell 发表了题为:Mesoscale DNA Feature in Antibody-Coding Sequence Facilitates Somatic Hypermutation 的研究长文。该研究系统揭示了抗体基因互补决定区(CDR)偏好性突变背后的生化机制,特别是抗体基因编码序列DNA柔韧性的重要生理作用。这项研究解决了困扰免疫学家40多年的科学难题,为优化现有动物模型及推动下一代抗体基因人源化动物模型的发展提供了全新的见解。
青科沙龙第48期丨小鼠胚胎干细胞中METTL14非依赖于m6A的调控转录功能
2023-09-18
2023年2月23日,北京大学刘君研究员团队和美国芝加哥大学何川教授组在Protein & Cell在线发表了题为METTL14 is a chromatin regulator independent of its RNA N6-methyladenosine methyltransferase activity的研究论文。这项工作揭示了METTL14非依赖于METTL3和m6A的对于异染色质和RNA转录的新型调控机制,以及这种调控功能在小鼠胚胎干细胞干性维持和分化中的重要作用。
青科沙龙第47期丨Nature一作解读:一个新的无机磷存储细胞器调控肠道发育及稳态
2023-09-18
2023年5月4日,哈佛大学Norbert Perrimon研究团队在Nature杂志发表了题为 “A phosphate-sensing organelle regulates phosphate and tissue homeostasis” 的研究论文。该研究首次鉴定了昆虫肠道细胞中存储磷的细胞器,并发现了无机磷酸盐参与肠道稳态调控的机制。
青科沙龙第46期丨白术内酯II激活DGKQ抑制sn-1,2-DAG-PKC信号轴改善肥胖型胰岛素抵抗
2023-09-18
2022年12月16日,中国药科大学天然药物活性组分与药效国家重点实验室李萍/杨华/郑祖国团队在Cell Metabolism在线发表题为“Discovery of a potent allosteric activator of DGKQ that ameliorates obesity-induced insulin resistance via the sn-1,2-DAG-PKCε signaling axis”的研究论文。
青科沙龙第44期丨流感病毒感染诱导的肺泡巨噬细胞训练免疫在肺部抗肿瘤免疫应答中的作用及机制研究
2023-09-18
2023年2月20日,浙江大学姚雨石团队在Nature Immunology (IF=31)在线发表题为“Influenza-trained mucosal-resident alveolar macrophages confer long-term antitumor immunity in the lungs”的研究论文,该研究利用流感和肺转移瘤的小鼠模型表明流感训练呼吸道黏膜驻留的肺泡巨噬细胞(AMs),以发挥持久的和组织特异性的抗肿瘤免疫。训练的AMs浸润肿瘤病变,并增强吞噬和肿瘤细胞的细胞毒功能,这与肿瘤诱导的免疫抑制的表观遗传,转录和代谢抗性有关。
青科沙龙第43期丨NF-κB信号通路能够高效增强STING介导的先天免疫并揭示其分子机制
2023-09-18
2023年2月28日,清华大学药学院张从刚课题组以及尹航课题组在Cell Reports期刊发表了题为“NF-κB activation enhances STING signaling by altering microtubule-mediated STING trafficking” 的研究论文。该研究发现所有途径(如Toll-like receptor [TLRs]、interleukin-1 receptor [IL-1R]、tumor necrosis factor receptor [TNFR]、growth factor receptors [GF-Rs]、protein kinase C [PKC])激活的NF-κB信号通路,都可以诱导细胞内microtubule解聚,进而阻滞STING通过microtubule迁移到lysosome进行降解的过程,最终高效增强STING介导的先天免疫反应及机体抗病毒能力。
青科沙龙第42期丨亨廷顿基因敲入猪模型与基因治疗
2023-09-18
2023年2月16日,暨南大学粤港澳中枢神经再生研究院李晓江教授,李世华教授,闫森研究员,联合中国科学院广州生物医药与健康研究院赖良学研究员在Nature Biomedical Engineering上发表题为 Cas9-mediated replacement of expanded CAG repeats in a pig model of Huntington’s disease 的研究论文 。该工作利用AAV病毒载体表达CRISPR/Cas9基因编辑的技术修复及敲除亨廷顿猪模型的突变基因,首次在国际上证明基因治疗能有效的改善神经退行性疾病大动物模型的病理变化以及行为症状。
青科沙龙第41期丨优势等级地位下降导致抑郁样状态的神经机制
2023-09-18
2023年1月23日,浙江大学胡海岚教授团队(博士生范郑晓为第一作者)在 Cell 期刊发表题为:Neural Mechanism Underlying Depressive-Like State Associated with Social Status Loss 的研究论文。这项研究揭示了社会地位下降导致抑郁症的神经学机制——社会地位下降会触发负性奖赏预测误差,从而通过激活大脑中的反奖赏中枢外侧缰核(LHb),LHb的激活,既能诱导抑郁样行为,还能抑制负责调控社会竞争力的内侧前额叶皮层(mPFC),进一步加强在社会竞争中的退让。
青科沙龙第39期丨剪接因子SRSF10在小鼠精子发生过程中的功能和调控机制
2023-09-18
广州医科大学附属第三医院刘见桥教授和刘文博副研究员团队、广东省第二人民医院孙青原教授团队和中国科学院动物研究所王震波研究员团队合作在eLife发表了题为SRSF10 is essential for progenitor spermatogonia expansion by regulating alternative splicing 的研究论文,揭示了剪接因子SRSF10在维持精原祖细胞(progenitor spermatogonia)增殖以及存活过程中发挥的重要功能和作用机制。
青科沙龙第38期丨酸性微环境对T细胞功能分化的调控
2023-09-18
2023年1月30日,中国医学科学院系统医学研究院/苏州系统医学研究所李贵登、张连军团队与四川大学华西第二医院陈路团队合作在Nature Metabolism《自然-代谢》在线发表题为Extracellular acidosis restricts one-carbon metabolism and preserves T cell stemness(胞外酸度抑制一碳代谢维持T细胞的干性)的研究论文。该研究发现,长期胞外酸处理T细胞可抑制MYC-SLC7A5轴,阻碍T细胞内甲硫氨酸的摄入,进而重编程T细胞内的一碳代谢及表观遗传图谱,促进线粒体代谢适应性,最终维持干性T细胞状态。
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