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青科沙龙第57期丨绘制小鼠神经系统的单细胞时空谱系图谱

研究内容:

哺乳动物的发育伴随高度复杂的细胞命运特化过程——从多潜能干细胞逐步分化成熟为各种类型的细胞,进而形成高度异质性的组织器官。解析每个细胞在这一过程中的完整发育历程(即“谱系”)是发育生物学领域的重要目标之一。谱系的研究有助于人们理解生命个体的发育,解析发育相关疾病的发病机制,并为基于细胞治疗的再生医学研究中不同类型细胞药物的体外分化和制备,提供关键依据和线索。
近年来,人们为解析哺乳动物神经系统的谱系做出了巨大努力。然而,传统基于重组酶技术的谱系示踪通量有限,一般只能示踪1-2个谱系。最近的一些研究通过在侧脑室注射条形码标记的病毒,对脑室区(Ventricular Zone,VZ)的神经干细胞进行标记,并结合单细胞测序对这些细胞的子代细胞进行高通量谱系示踪。然而,这种方法只能标记 VZ 区的神经干细胞,无法实现对全脑任意脑区神经干细胞的标记,而且用病毒注射的方法标记早期胚胎中的细胞还存在技术障碍。因此,急需开发一种能够对脑内任意细胞群体进行高通量条形码标记和谱系示踪的新方法。
2023年7月17日,中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)陈跃军研究组在Nature Methods上发表了题为Comprehensive spatiotemporal mapping of single-cell lineages in developing mouse brain by CRISPR-based barcoding的文章。该研究通过建立能够应用于小鼠体内任意组织器官的谱系示踪新技术——CREST,解析了小鼠中脑在胚胎发育过程中的单细胞时空谱系图谱,揭示了小鼠中脑发育过程中新的谱系分化路径和分子调控机制。CREST技术为高通量解析小鼠组织器官发育的单细胞谱系提供了全新的工具,为从谱系视角研究各种发育疾病的发病机制提供了新的研究工具。


作者简介:

谢连顺,中国科学院脑科学与智能技术研究中心(神经所)在读博士研究生。2018年加入神经分化和再生课题组,在陈跃军研究员的指导下主要致力于哺乳动物神经系统发育的谱系和分子机制研究。近期,在利用条形码技术绘制小鼠脑内的单细胞时空谱系研究中取得了重要进展,相关研究工作发表于Nature Methods期刊。



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